近年来，阜阳市科技部门积极转变政府服务企业方式，从传统的点上扶持转到建设创新平台、强化整体效果上来，区域科技创新体系建设取得明显成绩。
一是以园区为主体的研发和新兴产业集聚中心正在形成。目前已建成安徽省太和生物医药和物流、界首粮食机械两个国家高新技术产业基地，引进和培育了一批研发实力强的龙头企业，带动企业技术研发和创新能力提升，延长产业链条，提高产业发展水平。太和、界首、阜南经济技术开发区创建省级创新园区稳步推进。启动阜阳国家级农业科技示范园区建设，提升农业科技示范效应，带动和加快农业现代化进程。阜合现代产业园已成为研发和新兴产业集聚的重要创新载体，正在向高新技术产业园区目标迈进。太和县为进一步集聚国内外高端医药创新资源，吸引更多高层次人才创新创业，正积极谋划建设太和医药创新基地，通过建设医药产业公共服务平台、中试研发大楼、标准化厂房和专家公寓等，为医药研发和产业化创造良好的服务环境。
二是以企业为主体的技术创新体系逐步完善。高新技术企业成为研发创新的主要载体，目前，全市动态保留高新技术企业数54家。2014年高新技术产业实现产值224.5亿元，同比增长20.9%，高新技术产业工业增加值55.5亿元，增长27%。鼓励企业自建或与高校院所联合共建各类创新研发平台，全市累计拥有企业工程技术中心27家，省级创新型企业30家，国家级创新型企业1家，以企业为主体，高等院校、科研院所为依托，自主创新与引进消化相结合的技术创新体系逐步形成，并促进了创新成果产出。全市R&D经费预计达到7亿元左右，比上年增长30%以上，占GDP的比重达到0.6%，比上年提升0.1个百分点。2014年全市专利申请量4331件，增长15.5%；专利授权量1310件，增长20.2%。全年共获批省级以上重大科技项目20项。
三是以产学研合作为依托的科技合作深入推进。深入开展校企对接活动，通过开展科技成果展示、对接、洽谈、交易、拍卖等形式，推进我市企业和国内外高校院所深度合作，促进国内外科技成果到阜阳交易、转化。2011—2012年度全市共登记重大科技成果151项,2013—2014年度重大科技成果170项，其中60%达到省内领先水平，一些项目达到国内领先或国内先进水平。2008年以来，全市有13项科技成果荣获省科学技术奖表彰。去年以来，全市技术合同成交额两年累计1.2亿元。产学研活动开展形式多样，2013年界首市组织12家机械制造业企业与合肥通用机械研究院开展产学研合作；安徽中医药大学专家组对太和县富民强县工程进行了专题指导；安徽科技学院分别与安徽永生堂药业有限公司、临泉县生产力促进中心签订了产学研合作协议，共建合作基地等等；组织安徽恒进农业发展有限公司、阜阳市殿兴农业科技有限公司、阜阳市春江农业科技有限公司等8家单位参加了在马鞍山举办的“安徽-以色列国际农业技术合作洽谈会”，阜阳市春江花卉与以色列的拉松农业发展有限公司签订了共建现代农业科技示范园的合作协议，恒进农业发展有限公司与以色列TAP农业项目公司签订了共建颍东现代农业示范区的合作协议。目前全市所有省级创新型企业都与大专院校和科研机构建立了各种形式或方式的产学研合作关系，为企业创新和发展奠定了良好基础。
四是以科技孵化器为核心的创业孵化器成效明显。对新认定为国家级、省级科技企业孵化器的，省、市财政给予资金支持。市科技企业孵化器为企业提供培训辅导、项目推介、市场推广等系列服务，目前已吸纳创新型小微企业15家，领域涉及电子商务、电子仪器等多个行业。市科技企业孵化器二期工程建设已开始前期工作。
五是以产业创新为主导的产业技术创新战略联盟加快建设。支持行业骨干企业与科研院所、高等学校联合组建产业技术创新战略联盟、产业共性技术研发基地等产学研用合作体。对新认定为国家级战略联盟的，省、市财政给予资金支持。探索建立高校与科研院所、企业深度融合的协同创新模式,建设一批市级协同创新中心。支持行业骨干企业联合上下游企业建立集成创意、研发、设计、制造、管理、营销、物流、服务于一体的产业创新链条。目前，全市已建成安徽省保健制品及再生塑料制品产业技术创新战略联盟2家，安徽省包装技术产业创新战略联盟已获省认定筹建。
