四川公布我国首个牧草(鸭茅)基因组

鸭茅是世界四大禾本科栽培牧草之一，在我国西南地区广泛种植使用，因其抗旱性强、耐贫瘠、耐荫性强以及产量高、草质柔嫩、适口性好、营养价值高等特点，可用于青饲、青贮或调制干草，在边际土地及石漠化深度贫困区草牧业发展中发挥着重要作用。在四川省农作物及畜禽育种攻关计划持续支持下，四川农业大学饲草育种团队潜心钻研，采用三代测序技术结合Hi-C和Bionano辅助组装技术,从鸭茅中鉴定到40088个蛋白编码基因，其中1173个基因家族是鸭茅特有基因，并挖掘出4个控制开花性状的潜在调控基因，基因组组装的相关参数较好，是已经公布的白三叶、黑麦草基因组的20- -50倍。研究成果于2019年在植物学权威期刊《Plant Biotechnology Jourmal》 在线发表了题为《Genome assembly provides insights into the genome evolution and flowering regulation of orchardgrass》的研究论文，首次公布了鸭茅的高质量参考基因组，也是我国第一个公布的牧草参考基因组。该研究成果为鸭茅后续育种提供了基础信息支撑，可将育种周期从15年缩短为8-10年，有助于选育更多优质、高产、适应性强的鸭茅新品种，同时对我国牧草基因资源挖掘工作具有借鉴意义。鸭茅基因组数据库网站已于2019年8月上线，有复旦大学、新西兰皇家科学院农业研究所等中外学者访问，查找相关基因位置与表达，以及下载基因序列，访问量近5000次。